MongoDB
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Remova o elemento array de TODOS os documentos usando o driver MongoDB C#


No seu caso faça algo assim:
db.collectionname.find({}).forEach(function(item) {
var ar = item.area;
for(var i = 0; i < ar.length; ++i) { 
    var x = ar[i];
    delete (x["discoveredBy"]);

}
db.collectionname.save(item);});