Esquema do modelo Mongoose com matriz de referência:CastError:Cast to ObjectId falhou para valor [object Object]

Seu esquema de artigo espera uma matriz de ObjectId :

var ArticleSchema = new Schema({
  ...
  categories: [{ 
    type: Schema.Types.ObjectId, 
    ref: 'Category' }]
});

No entanto, req.body contém um objeto de categoria:

categories:
   [ { _id: '53c934bbf299ab241a6e0524',
     name: '1111',
     parent: '53c934b5f299ab241a6e0523',
     __v: 0,
     subs: [],
     sort: 1 } ]

E o Mongoose não pode converter o objeto de categoria em um ObjectId . É por isso que você recebe o erro. Certifique-se de que as categories em req.body contém apenas ids:

{ title: 'This is title',
  content: '<p>content here</p>',
  categories: [ '53c934bbf299ab241a6e0524' ],
  updated: [ 1405697477413 ] }