Você pode matar o mongod anterior instância e inicie a nova.
Para matar a instância mongod anterior, primeiro procure uma lista de tarefas em execução em sua máquina digitando,
sudo lsof -iTCP -sTCP:LISTEN -n -P
Procure por mongod COMMAND e seu PID e tipo,
sudo kill <mongo_command_pid>
Agora inicie sua instância do mongod digitando,
mongod
Você pode ver o MongoDB rodando com sucesso.
