Infelizmente, não há opção para especificar "INSERIR IGNORE". Foi assim que contornei essa limitação para inserir linhas nesse banco de dados que não eram duplicadas (o nome do dataframe é df)
for i in range(len(df)):
try:
df.iloc[i:i+1].to_sql(name="Table_Name",if_exists='append',con = Engine)
except IntegrityError:
pass #or any other action
