Fiquei confuso durante 3 dias porque o mesmo problema.

Mas, encontrei resolver este problema:

1. 
   instale o arquivo .vsix em seu ambiente visual studio. https://github.com/npgsql/npgsql/releases/tag/v3 .1.8 (NpgsqlDdexProvider)
   
2. 
   instale Npgsql e EntityFramework6.Npgsql pelo Nuget Package Manager.
   
3. 
   Construa seu projeto. (Para aplicar a configuração do App.xaml modificado pelo Nuget)
   
4. 
   Você pode usar a geração de modelo de entidade ADO.NET.
   

Além disso, o dotConnect não suporta o Entity Model na versão Express. É suportado apenas na versão comercial.

Mas atualmente, o Npgsql fechou imediatamente o bug no EDM. então, eu encontrar solução.