Configuração da minha máquina- Ubuntu 16.04- MySql 5.7.13- PHP 7.0.8- Apache 2.4.18

Edite o arquivo /etc/dbconfig-common/phpmyadmin.conf, alterando

dbc_dbport='' para dbc_dbport='0'

Após editar o arquivo e salvá-lo, se você ainda estiver no assistente dbconfig-common, selecione retry; se não, execute sudo dpkg-reconfigure phpmyadmin (escolha Sim quando perguntado se você deseja reinstalar o banco de dados para phpmyadmin) e continue normalmente sem alterar nenhum valor. Se você quiser alterar algum valor, faça-o no arquivo que você editou anteriormente.

Quando a janela de configuração perguntar o que você deseja fazer com o arquivo de configuração existente, escolha Manter a versão local atualmente instalada .

Neste ponto você pode verificar as diferenças e apenas devem existir aquelas que você fez no arquivo.