Eu acredito que o problema pode estar no fato de que você está dando um objeto Python para
app.config.from_object
quando espera uma string. Dos documentos:app = Flask(__name__)
app.config.from_object('yourapplication.default_settings')
app.config.from_envvar('YOURAPPLICATION_SETTINGS')
http://flask.pocoo.org/docs/0.10/ config/#configuring-from-files
Então, no seu caso, você pode querer fazer algo como:
app.config.from_object('your_app.config.{}'.format(config_name))
onde
config_name
corresponde ao objeto em seu config.py.