A melhor opção seria usar o método shell nativo cat() .
Digamos que seu arquivo tenha o seguinte conteúdo e esteja localizado em /home/desktop/myfile.txt
row1
row2
row3
row4
O código a seguir permitirá que você obtenha o conteúdo do arquivo como matriz em string var:
$> var string = cat('home/desktop/myfile.txt');
$> string = string.split('\n');
$> db.records.find({field: {$in: string}});
