MongoDB
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Chamando um procedimento armazenado no MongoDB via C#


Então eu apenas fiz um teste localmente. Com
db.system.js.save({
    _id : "myAddFunction" ,
    value : function (x, y){ return x + y; }
});

Eu tenho uma função salva myAddFunction. Com uma pequena modificação do seu código:
MongoClient client = new MongoClient("mongodb://192.168.122.1/test");
MongoServer server = client.GetServer();
MongoDatabase test = server.GetDatabase("test");

Console.WriteLine("Input two numbers: ");
string num1Str = Console.ReadLine();
string num2Str = Console.ReadLine();
int num1 = int.Parse(num1Str);
int num2 = int.Parse(num2Str);

BsonValue bv = test.Eval("myAddFunction");
BsonValue bv1 = test.Eval(bv.AsBsonJavaScript.Code, num1, num2);
Console.WriteLine(bv1);

Agora eu recebo o resultado certo exibido.