Você deve poder colocar as mesmas instruções SQL na propriedade initConnectionSqls do elemento de configuração DBCP. Basta adicionar isso ao elemento de configuração DBCP
<property name="initConnectionSqls" value="SET time_zone = '${database.timezone}'"/>
Dependendo da sua versão do DBCP, talvez seja necessário usar connectionInitSqls como o nome da propriedade. Essas informações são diretamente da configuração DBCP documentação.
