Várias consultas MYSQL na tabela de várias colunas

Ok, o otimizador de consultas parece ter alguns problemas com minha resposta anterior com tabelas grandes. Tente esta solução, ela funciona com subconsultas dependentes:

SELECT DATE_FORMAT(timeTable.minuteTime, '%Y-%m-%d %k:%i') time,
T2.temp temp,
S2.solids solids,
P2.Ph Ph
FROM
(
    SELECT minuteTime.minuteTime minuteTime,
    ( SELECT MAX(time) FROM temperature WHERE time <= minuteTime.minuteTime AND time >= NOW() - INTERVAL 1 HOUR) tempTime, 
    ( SELECT MAX(time) FROM ph WHERE time <= minuteTime.minuteTime AND time >= NOW() - INTERVAL 1 HOUR) phTime,  
    ( SELECT MAX(time) FROM solids WHERE time <= minuteTime.minuteTime AND time >= NOW() - INTERVAL 1 HOUR) solidsTime
    FROM  
    (
        SELECT time + INTERVAL 59 - SECOND( time ) SECOND minuteTime
        FROM Ph
        WHERE time >= NOW() - INTERVAL 1 HOUR AND time <= NOW()
        UNION SELECT time + INTERVAL 59 - SECOND( time ) SECOND
        FROM solids
        WHERE time >= NOW() - INTERVAL 1 HOUR AND time <= NOW()
        UNION SELECT time + INTERVAL 59 - SECOND( time ) SECOND
        FROM temperature
        WHERE time >= NOW() - INTERVAL 1 HOUR AND time <= NOW()
        GROUP BY 1
    ) minuteTime
) timeTable
LEFT JOIN temperature T2 ON T2.time = timeTable.tempTime
LEFT JOIN solids S2 ON S2.time = timeTable.solidsTime
LEFT JOIN ph P2 ON P2.time = timeTable.phTime
ORDER BY minuteTime ASC

Configurei as três tabelas com cerca de 800.000 linhas de dados de teste, cada uma. No MySQL 5.5.30, a consulta acima é executada em cerca de 3,5 segundos e retorna 61 linhas de resultado. Mas você absolutamente precisa ter índices em cada uma das colunas de tempo:

ALTER TABLE `ph` ADD INDEX ( `time` ) ;
ALTER TABLE `solids` ADD INDEX ( `time` ) ;
ALTER TABLE `temperature` ADD INDEX ( `time` ) ;

Caso contrário, a consulta não será encerrada. Acredito que nenhuma consulta manipulando essa quantidade de dados o fará.