Mysql
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Otimize a consulta do MySql:muito lento ao fazer o pedido


Em vez de colocar o Order By na consulta principal, envolva-a, assim:
SELECT * FROM (   
  ... your query
) ORDER BY `created at`

Dê uma olhada no plano de consulta. Você descobrirá que, no seu caso, a classificação é realizada em sua tabela mtrt_items antes que a junção externa seja executada. Na reescrita que forneci parcialmente, a classificação é aplicada após as junções externas e é aplicada em um conjunto muito menor.

ATUALIZAÇÃO

Supondo que o LIMIT esteja sendo aplicado a um conjunto grande (500.000?), parece que você pode executar o topo antes de fazer qualquer uma das junções.
SELECT * from (
    SELECT 
    `id`, ... `created_at`, ...
    ORDER BY `i`.`created_at` DESC 
    LIMIT 100 OFFSET 0) as i

    LEFT JOIN `mtrt_users` AS `u` ON i.user_id =u.id

    LEFT JOIN `twt_tweets_content` AS `t` ON t.id =i.id
    LEFT JOIN `twt_users` AS `tu` ON t.user_id = tu.id

    INNER JOIN `mtrt_items_searches` AS `r` ON i.id =r.item_id
    INNER JOIN `mtrt_searches` AS `s` ON s.id =r.search_id
    INNER JOIN `mtrt_searches_groups` AS `sg` ON sg.search_id =s.id
    INNER JOIN `mtrt_search_groups` AS `g` ON sg.group_id =g.id
    INNER JOIN `account_clients` AS `c` ON g.client_id =c.id                

GROUP BY i.id