Posso recomendar estas configurações para melhorar o tempo de carregamento:

• innodb_doublewrite =0
• innodb_support_xa =0
• innodb_buffer_pool_size =(50-80% da memória do sistema)
• innodb_log_file_size =(um número grande - 256 milhões etc)
• innodb_flush_log_at_trx_commit =0

Além das configurações, há algumas coisas que você mesmo pode fazer:

• Crie índices após o carregamento (esta é uma nova otimização com o plug-in 5.5 / InnoDB).
• Classifique o arquivo de dados antes de carregar.
• Divida o arquivo de dados e carregue em paralelo.