delete from myTable
where id not in
(select min(id)
from myTable
group by A, B)
ou seja, o select entre colchetes retorna o primeiro id para cada agrupamento de A e B; excluir todos os ids que não estão neste conjunto removerá todas as ocorrências de uma combinação A-mais-B que são "subseqüentes" à sua primeira ocorrência.
EDITAR :esta sintaxe parece ser problemática:veja o relatório de bug:
http://bugs.mysql.com/bug.php?id=5037
Uma possível solução é fazer isso:
delete from myTable
where id not in
(
select minid from
(select min(id) as minid from myTable group by A, B) as newtable
)
