(Publicando meu comentário como uma resposta, pois aparentemente isso fez a diferença!)
Se alguém quiser investigar isso mais a fundo acabei de fazer um teste e achei muito fácil de reproduzir.
Criar a tabela
CREATE TABLE `filler` (
`id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
PRIMARY KEY (`id`)
)
Criar procedimento
CREATE PROCEDURE `prc_filler`(cnt INT)
BEGIN
DECLARE _cnt INT;
SET _cnt = 1;
WHILE _cnt <= cnt DO
INSERT
INTO filler
SELECT _cnt;
SET _cnt = _cnt + 1;
END WHILE;
END
Preencher Tabela
call prc_filler(5000)
Consulta 1
SELECT id
FROM filler
WHERE id = (SELECT MAX(id) FROM filler WHERE id =
( SELECT MIN(id)
FROM filler
WHERE id between 2000 and 3000
)
)
Equals Explain Output http://img689.imageshack.us/img689/5592/equals. png
Consulta 2 (mesmo problema)
SELECT id
FROM filler
WHERE id in (SELECT MAX(id) FROM filler WHERE id in
( SELECT MIN(id)
FROM filler
WHERE id between 2000 and 3000
)
)
Na saída de explicação http://img291.imageshack.us/img291/8129/52037513. png