1. 
   O MySQL determina se uma consulta é ou não uma 'grande seleção' com base no valor de 'max_join_size'. Se for provável que a consulta precise examinar mais do que esse número de linhas, ela a considerará uma 'grande seleção'. Use 'show variables' para visualizar o valor do tamanho máximo da junção.
   
2. 
   Acredito que a indexação e, em particular, uma boa cláusula where impedirá que esse problema ocorra.
   
3. 
   SQL_BIG_SELECTS é usado para evitar que os usuários executem acidentalmente consultas excessivamente grandes. Não há problema em configurá-lo como ON no mysql.cnf ou usando a opção de linha de comando na inicialização.
   
4. 
   Você pode definir SQL_BIG_SELECTS em my.cnf ou na inicialização do servidor. Também pode ser definido por sessão com SET SESSION SQL_BIG_SELECTS=1 .
   
5. 
   Não que eu possa pensar. Eu apenas verificaria sua consulta para ter certeza de que você realmente precisa usá-la. Nossos servidores estão ativados por padrão, e max_join_size é muito grande.