MySQL como preencher datas ausentes no intervalo?

1. 
   Crie uma tabela que contenha apenas números incrementais - fácil de fazer usando um auto_increment:
   

   DROP TABLE IF EXISTS `example`.`numbers`;
   CREATE TABLE  `example`.`numbers` (
     `id` int(10) unsigned NOT NULL auto_increment,
      PRIMARY KEY  (`id`)
   ) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=latin1;
   

2. 
   Preencha a tabela usando:
   

   INSERT INTO `example`.`numbers`
     ( `id` )
   VALUES
     ( NULL )
   

   
   ...para quantos valores você precisar.
   
3. 
   Use DATE_ADD para construir uma lista de datas, aumentando os dias com base no valor NUMBERS.id. Substitua "2010-06-06" e "2010-06-14" por suas respectivas datas de início e término (mas use o mesmo formato, AAAA-MM-DD) -
   

   SELECT `x`.*
     FROM (SELECT DATE_ADD('2010-06-06', INTERVAL `n`.`id` - 1 DAY)
             FROM `numbers` `n`
            WHERE DATE_ADD('2010-06-06', INTERVAL `n`.`id` -1 DAY) <= '2010-06-14' ) x
   

4. 
   LEFT JOIN em sua tabela de dados com base na parte do tempo:
   

      SELECT `x`.`ts` AS `timestamp`,
             COALESCE(`y`.`score`, 0) AS `cnt`
        FROM (SELECT DATE_FORMAT(DATE_ADD('2010-06-06', INTERVAL `n`.`id` - 1 DAY), '%m/%d/%Y') AS `ts`
                FROM `numbers` `n`
               WHERE DATE_ADD('2010-06-06', INTERVAL `n`.`id` - 1 DAY) <= '2010-06-14') x
   LEFT JOIN TABLE `y` ON STR_TO_DATE(`y`.`date`, '%d.%m.%Y') = `x`.`ts`
   

DATE_FORMAT(`x`.`ts`, '%d.%m.%Y') AS `timestamp`