Se entendi certo, você instalou o pgAagent, mas ele não está iniciando quando você executa os trabalhos. Já tentou iniciá-lo pelo terminal? O serviço pode estar inativo (eu o inicio manualmente toda vez que o sistema de banco de dados é reiniciado).
Usando o usuário postgres...
sudo su - postgres
... execute o seguinte comando (supondo que você esteja no servidor db):
pgagent hostaddr=127.0.0.1 dbname=postgres user=postgres -s pgagent_log.log
Espero que ajude.Cheers!
