Se você estiver usando o WHM/Cpanel, para alterar o limite "Max:50MiB" na seção de importação do phpmyadmin, você terá que alterar dois valores no WHM (Web Host Manager).

Passo 1) Vá para Tweak settings, encontre o "cPanel PHP Max upload size" e altere-o de acordo com suas necessidades. Salve as alterações.

Passo 2) Vá para Tweak settings, encontre o "cPanel PHP Max POST size" e altere-o de acordo com suas necessidades. Salve as alterações.

Volte para o seu phpMyadmin. O valor deveria ter mudado.