Tente importá-lo do console mysql de acordo com o gosto do seu sistema operacional.
mysql -u {DB-USER-NAME} -p {DB-NAME} < {db.file.sql path}
ou se estiver em um servidor remoto, use o sinalizador -h para especificar o host.
mysql -u {DB-USER-NAME} -h {MySQL-SERVER-HOST-NAME} -p {DB-NAME} < {db.file.sql path}