As coleções GridFS são detalhes de implementação interna do GridFS. Não há ligação entre eles e seus outros dados.
Para escrever e ler do GridFS, você usaria as APIs do GridFS fornecidas pelo seu driver. Geralmente, isso significa que, se você estiver salvando, por exemplo, alguns campos e um blob binário como uma imagem, você executará o salvamento em duas etapas (uma operação de inserção/atualização para os campos e uma operação GridFS separada para o blob binário).
Você não armazenaria a imagem em seu documento . Você armazenaria a imagem no GridFS , e em seu documento você pode incluir uma referência ao arquivo GridFS (eles têm seus próprios ids).