Da especificação do Mongo :

Portanto, você precisaria de um BINARY(12) digite coluna para mapeá-lo em SQL.

De qualquer forma, seu código ficará sem memória em qualquer transferência de significado, usar uma cópia intermediária na memória do DataTable não é o caminho a seguir. EnableStreaming e use um IDataReader para iterar sobre a fonte just-in-time.