comecei a usar o mongoDB esta manhã e me deparei com o mesmo problema. Eu estava procurando por um valor específico, encontrei, mas obtive o mesmo resultado que você. Acabei de colocar "[0]" no e obtive o resultado. Como eu disse, acabei de começar a usar o mongoDB, é por isso que não sei por que isso acontece.
Isso me deu meu resultado:db.find({"key":"value"})[0]