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MongoDB:Verifique se o valor é nulo ou o array está vazio


Você pode usar o $or operador de consulta com uma verificação para cada condição:
{
  $or: [{
    // Check about no Company key
    Company: {
       $exists: false
    }
  }, {
    // Check for null
    Company: null
  }, {
    // Check for empty array
    Company: {
       $size: 0
    }
  }]
}