Ok, depois de pesquisar o código e perceber que o mongo lib contém implementações nativas de todos os métodos necessários, reutilizei a solução de agregação() de https://github.com/meteor/meteor/pull/644
Alterações simples e tradução para coffeescript fornecem o seguinte snippet para colocar no código do lado do servidor:
path = __meteor_bootstrap__.require("path")
MongoDB = __meteor_bootstrap__.require("mongodb")
Future = __meteor_bootstrap__.require(path.join("fibers", "future"))
myCollection = new Meteor.Collection "my_collection"
#hacky distinct() definition from https://github.com/meteor/meteor/pull/644
myCollection.distinct = (key)->
future = new Future
@find()._mongo.db.createCollection(@_name,(err,collection)=>
future.throw err if err
collection.distinct(key, (err,result)=>
future.throw(err) if err
future.ret([true,result])
)
)
result = future.wait()
throw result[1] if !result[0]
result[1]
A desvantagem é que você tem que defini-lo para cada nova coleção, mas isso é bem simples de corrigir com outro hack via _.extend ou algo assim, eu acho...
PS Agora também é um pacote inteligente -
mrt add mongodb-aggregation 
