Eu tive esse mesmo problema e não consegui resolver. Acabei criando um novo cluster no Azure (em vez de AWS) e parece estar funcionando bem.
Não tenho certeza se isso é um problema com sua implementação na AWS ou configuração incorreta caso a caso
Atualizar :O mesmo erro está acontecendo agora no novo cluster. Eu levantei um ticket e obtive a seguinte resposta;
Eles disseram a mesma coisa que a outra resposta. Por favor, use M10. No entanto, o M10 custa cerca de US $ 60/m, o que não é exatamente uma resolução. Também invalida completamente o principal ponto de venda deles dizendo que o M0 agora inclui o MongoDb 4.0