Você pode alternar para outro banco de dados assim:
mongodb.MongoClient.connect(mongourl, function(err, database) {
// switch to another database
database = database.db(DATABASE_NAME);
...
});
(documentos )
EDITAR :para esclarecimento:isso também permite abrir vários bancos de dados na mesma conexão:
mongodb.MongoClient.connect(mongourl, function(err, database) {
// open another database over the same connection
var database2 = database.db(DATABASE_NAME);
// now you can use both `database` and `database2`
...
});