Parece uma pergunta antiga, então talvez você já tenha uma solução, mas aqui como eu lidei com o mesmo problema:
@Query(value = "{'title': {$regex : ?0, $options: 'i'}}")
Foo findByTitleRegex(String regexString);
usando o
/?0/ notação não funcionará, pois o Spring Data coloca um valor String com aspas 
