Eu diria que tudo isso não é necessário. Você pode proceder de maneira simples da seguinte forma:Isso requer um pacote chamado "rmongodb" no R. Este pacote requer a versão mais recente e não estaria presente nas versões anteriores. Este pacote lida com mongodb. Existem outros pacotes como o "RMongo".
para instalar o rmongodb em R
install.packages("rmongodb")
Para converter grandes dados do MongoDB em um quadro de dados em R
library(rmongodb)
mongo <- mongo.create() # create a connection to mongodb localhost
mongo.is.connected(mongo) # check whether mongodb is connected
mongo.get.databases(mongo) #shows all databases present in mongodb
mongo.get.database.collections(mongo,"mydb") #displays all collections present in database mydb
data <- mongo.find.all(mongo,"mydb.collection",data.frame=TRUE) # This would suffice as this would convert the entire list into a data frame in R.