Você pode usar ISODate para comparar datas:
"$lte" : ISODate("2015-06-17T10:03:46Z")
ISODate funciona porque esse é o formato em que sua data está.
new Date()
envolve a data em um auxiliar ISODate, mas não consegue converter em sua consulta.
Confira este link para mais informações:http://docs.mongodb.org/manual/core/shell-types/