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Preencher datas faltantes nos registros


Você precisa de alguns estágios adicionais para retornar valores padrão. Primeiro de tudo você precisa usar $group com _id definido como null para coletar todos os resultados em um documento. Então você pode usar $map com uma matriz de dias como entrada. Dentro desse $map você pode usar $indexOfArray para descobrir se essa data existe em seu conjunto de resultados atual. Se sim (index != -1 ) então você pode retornar esse valor, caso contrário, você precisa retornar o subdocumento padrão com views definido como 0 . Então você pode usar $unwind para recuperar uma lista de documentos e $replaceRoot para promover stats aninhadas a um nível superior.
ProductView.aggregate([
    { $match: { productId: '5b8c0f3204a10228b00a1745' } },
    { $project: { day: { $substr: ["$createdAt", 0, 10] } } },
    {
        $group: {
            _id: "$day",
            count: { $sum: 1 },
            time: { $avg: "$createdAt" },
        }
    },
    { $sort: { _id: 1 } },
    {
        $project: {
            date: '$_id',
            views: '$count',
        },
    },
    {
        $group: {
            _id: null,
            stats: { $push: "$$ROOT" }
        }
    },
    {
        $project: {
            stats: {
                $map: {
                    input: [ "2018-09-01", "2018-09-02", "2018-09-03", "2018-09-04", "2018-09-05" ],
                    as: "date",
                    in: {
                        $let: {
                            vars: { dateIndex: { "$indexOfArray": [ "$stats._id", "$$date" ] } },
                            in: { 
                                $cond: {
                                    if: { $ne: [ "$$dateIndex", -1 ] },
                                    then: { $arrayElemAt: [ "$stats", "$$dateIndex" ] },
                                    else: { _id: "$$date", date: "$$date", views: 0 }
                                } 
                            }
                        }
                    }
                }
            }
        }
    },
    {
        $unwind: "$stats"
    },
    {
        $replaceRoot: {
            newRoot: "$stats"
        }
    }
]).exec((err, result) => ...)

Você pode gerar uma lista estática de datas na lógica do aplicativo usando um loop simples. Acredito que isso também seja possível no MongoDB (usando $range), mas pode complicar esse pipeline de agregação. Deixe-me saber se você está bem com isso ou deseja tentar gerar essa matriz de datas no MongoDB.