MySQL GROUP BY não funciona quando migrado para o SQL Server 2012

O SQL Server está funcionando conforme o esperado. Você deve incluir todos os itens em seu SELECT list em um GROUP BY ou em uma função agregada:

SELECT *,(XS+S+M+L+XL+XXL+[1Size]+Custom) as Total 
FROM StockData  
-- GROUP BY ID,StyleNr,Customer,Color, XS,S,M,L,XL,XXL,[1Size],Custom
ORDER BY StyleNr,Customer,Color

Ou você pode usar:

SELECT StyleNr,Customer,Color, SUM(XS+S+M+L+XL+XXL+[1Size]+Custom) as Total 
FROM StockData  
GROUP BY StyleNr,Customer,Color
ORDER BY StyleNr,Customer,Color;