Como salvar dados em uma página thymeleaf em várias linhas sql

Você está usando o envio de formulário para salvar dados complexos, o que é muito complicado, em vez de escrever java script e salvar suas informações no objeto javascript e enviar a string json para o controlador para salvar com a lista.

Por enquanto, com sua implementação, a solução hacky simples seria essa.

1) implementação saveTimeTable com o seguinte

@RequestMapping(value="/timeTableMapping/saveAll",method=RequestMethod.POST)public String saveTimeTable(@ModelAttribute("timeTableMapping") TimeTableMapping timeTableMapping){

String[] dayArray = timeTableMapping.getDay().split(",");
String[] subArray = timeTableMapping.getSubject_code().split(",");  


List<TimeTableMapping> tempList = new ArrayList<>();
for(int i = 0 ; i < dayArray.length; i++) {
    TimeTableMapping tempTimeTable = new TimeTableMapping();
    tempTimeTable.setTime_table_code(timeTableMapping.getTime_table_code());        
    tempTimeTable.setDay(dayArray[i]);
    tempTimeTable.setSubject_code(subArray[i]);
    tempTimeTable.setStart(timeTableMapping.getStart());
    tempTimeTable.setEnd(timeTableMapping.getEnd());
    tempList.add(tempTimeTable);
}   
timeTableMappingDAO.saveAll(tempList);
    return  "redirect:/timeTableMapping";
}