MySql:Ordenar por e Grupo Combinando não dando o registro mais recente

Como você pode GROUP BY id_thread quando não há id_thread coluna na sua tabela?

SELECT * 
FROM contacts 
WHERE id_receiver = 1 
                                 --- GROUP BY id_thread
                                 --- removed 
ORDER BY created DESC
LIMIT 1                          --- only show one row

Com base em seus comentários, o que você quer é o mais recente (ordenado por created ) para cada id_thread , que é uma consulta diferente e mais complexa. Existe até uma tag para esse tipo de consulta, chamada [greatest-n-per-group] .

SELECT c.* 
FROM contacts AS c
  JOIN
    ( SELECT id_thread, MAX(created) AS created 
      FROM contacts 
      WHERE id_receiver = 1  
      GROUP BY id_thread
    ) AS g 
    ON (g.id_thread, g.created) = (c.id_thread, c.created) 
WHERE c.id_receiver = 1