Você pode usar as getGeneratedKeys método. Esta postagem do fórum vai ajudar.
Também recomendo que você use uma ferramenta ORM como Hibernar . No Hibernate você faria algo assim:
myTable = new myTable();
myTable.prop1 = prop1;
myTable.prop2 = prop2;
int id = session.save(myTable);
O Hibernate emitirá os comandos SQL apropriados (dependendo do banco de dados selecionado) e retornará o id gerado automaticamente.
