Ele não executa sem fim ciclo.

A razão para isso é porque o servidor executa FULL TABLE SCAN que é muito lento. Esta condição si.id = fnc_FindIssueId(so.id) não usa um índice mesmo que você tenha definido um em si.id e so.id .

As melhores maneiras que você pode fazer são:

• para alterar a tabela smart_objects
• outra coluna para o assigned issue Id
• defina um índice na nova coluna