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MySQL 8 Calculando a média por particionamento por data


Você pode usar funções de janela. O truque é obter uma soma de janela da pontuação total por funcionário para cada dia, assim:
select
    employee_name,
    date(created_at) created_date,
    100 * sum(score) / sum(sum(score)) over(partition by date(created_at)) monthly_score
from scores
group by employee_name, date(created_at)

Em seu DB Fiddle , isso produz:
| employee_name | created_date | monthly_score |
| ------------- | ------------ | ------------- |
| John          | 2020-04-01   | 30.27         |
| Bob           | 2020-04-01   | 69.73         |
| John          | 2020-04-02   | 15.55342      |
| Bob           | 2020-04-02   | 68.42864      |
| James         | 2020-04-02   | 16.01794      |