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Como consultar o SQL pai-filho para o formato JSON específico?


Você pode gerar conteúdo JSON diretamente do MySQL. Aqui está uma solução que funciona com o MySQL 5.7 ou superior.

Para começar, considere a função JSON_OBJECT() , que gera um objeto JSON para cada registro na tabela:
SELECT 
    p.*, 
    JSON_OBJECT('id', id, 'project_name', project_name, 'parent_id', parent_id) js
FROM tbl_projects p;

Dados seus dados de amostra, isso retorna:
| id  | project_name        | parent_id | js                                                               |
| --- | ------------------- | --------- | ---------------------------------------------------------------- |
| 1   | Carmichael House    | 0         | {"id": 1, "parent_id": 0, "project_name": "Carmichael House"}    |
| 2   | Carmichael Kitchen  | 1         | {"id": 2, "parent_id": 1, "project_name": "Carmichael Kitchen"}  |
| 3   | Carmichael Bathroom | 1         | {"id": 3, "parent_id": 1, "project_name": "Carmichael Bathroom"} |
| 4   | Dowd Apartment      | 0         | {"id": 4, "parent_id": 0, "project_name": "Dowd Apartment"}      |
| 5   | Dowd Kitchen        | 4         | {"id": 5, "parent_id": 4, "project_name": "Dowd Kitchen"}        |

Para gerar sua saída esperada, vamos auto-JOIN a tabela para encontrar registros filhos e use função agregada JSON_ARRAYAGG() para gerar a matriz JSON interna. Um nível adicional de agregação coloca tudo em um único objeto. Conforme mostrado em seus dados de exemplo, presumi que os projetos raiz têm parent_id = 0 e que existe apenas um nível de hierarquia:
SELECT JSON_OBJECT('projects', JSON_ARRAYAGG(js)) results
FROM (
    SELECT JSON_OBJECT(
        'id', p.id, 
        'project_name', p.project_name, 
        'parent_id', p.parent_id,
        'children', JSON_ARRAYAGG(
            JSON_OBJECT(
                'id', p1.id, 
                'project_name', p1.project_name, 
                'parent_id', p1.parent_id
            )
        )
    ) js
    FROM tbl_projects p
    LEFT JOIN tbl_projects p1 ON p.id = p1.parent_id
    WHERE p.parent_id = 0
    GROUP BY p.id, p.project_name, p.parent_id
) x

Rendimentos:
| results                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              |
| -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
| {"projects": [{"id": 1, "children": [{"id": 2, "parent_id": 1, "project_name": "Carmichael Kitchen"}, {"id": 3, "parent_id": 1, "project_name": "Carmichael Bathroom"}], "parent_id": 0, "project_name": "Carmichael House"}, {"id": 4, "children": [{"id": 5, "parent_id": 4, "project_name": "Dowd Kitchen"}], "parent_id": 0, "project_name": "Dowd Apartment"}]} |

Demonstração no DB Fiddle