Isso geralmente significa que você está tentando importar um objeto não sequenciado. Se o nome do arquivo de índice for
Index.js então você precisa alterá-lo em sua função de filtro (a primeira letra é maiúscula) return (file.indexOf(".") !== 0) && (file !== "Index.js");
Como é sensível a maiúsculas e minúsculas. Verifique também se não há nenhum outro arquivo em sua pasta de importação que não defina o modelo de sequelize. Se houver, basta adicioná-los à sua função de filtro.
