Você pode particionar uma tabela em várias unidades. Dê uma olhada no manual oficial, que aborda esse assunto em profundidade.
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5 /en/partitioning.html
Aqui está um exemplo para particionar uma tabela existente em várias unidades:
ALTER TABLE mytable
PARTITION BY RANGE (mycolumn)(
PARTITION p01 VALUES Less Than (10000)
DATA DIRECTORY = "/mnt/disk1"
INDEX DIRECTORY = "/mnt/disk1",
PARTITION p02 VALUES Less Than (20000)
DATA DIRECTORY = "/mnt/disk2"
INDEX DIRECTORY = "/mnt/disk2",
PARTITION p03 VALUES Less Than MAXVALUE
DATA DIRECTORY = "/mnt/disk3"
INDEX DIRECTORY = "/mnt/disk3"
);
Lembre-se de que isso precisa que NO_DIR_IN_CREATE esteja desativado. Parece não funcionar no Windows e não parece funcionar com o InnoDB.
Se você ficar sem espaço em disco em sua última partição, poderá dividi-la com a seguinte instrução:
ALTER TABLE mytable REORGANIZE PARTITION p03 INTO
(
PARTITION p03 VALUES Less Than (30000)
DATA DIRECTORY = "/mnt/disk3"
INDEX DIRECTORY = "/mnt/disk3",
PARTITION p04 VALUES Less Than MAXVALUE
DATA DIRECTORY = "/mnt/disk4"
INDEX DIRECTORY = "/mnt/disk4"
);