Com a ajuda da consulta SQL e do jar modificado para adicionar alguma depuração, finalmente descobri de onde vem o problema:seu projeto com id 39554 tem 2 instantâneos ativos (1234385 e 1234386). Este caso de uso não é gerenciado como isso nunca deveria acontecer.
Como este projeto não é analisado desde 2013-06-11, você também tem opções:
- Faça uma nova análise antes de fazer a migração para 5.0
- Exclua um dos dois instantâneos.