Você pode criar um
PRIMARY
ou UNIQUE
key de várias colunas (chamada de chave composta) no MySQL, que permitirá ON DUPLICATE KEY
para funcionar bem. // create a composite index
CREATE INDEX my_composite_index ON my_table (column1, column2);
// insert or update
INSERT INTO my_table (column1, column2) VALUES ('value1', 'value2') ON DUPLICATE KEY UPDATE column3=column3+1;