Consulte http://dev.mysql.com/doc/ refman/5.6/en/load-xml.html para os formatos XML suportados pelo LOAD XML INFILE demonstração.

A página do manual afirma:

Um dos formatos suportados se parece com o seu -- armazenando colunas como atributos de um <row> elemento.

Se você precisar transformar seus dados XML em um dos formatos suportados pelo LOAD XML do MySQL, provavelmente poderá usar xsltproc .

Eu diria que se seus dados XML não forem formatados com consistência perfeita, isso confundirá LOAD XML INFILE.