Você precisará compilá-lo manualmente, em vez de via PECL. Você precisará saber onde está sua instalação do MySQL. Não conheço os pacotes Entropy, mas as compilações fornecidas pelo MySQL (que eu recomendo) são instaladas em
/usr/local/mysql . $ pecl download pdo_mysql
$ tar xzf PDO_MYSQL-1.0.2.tgz
$ cd PDO_MYSQL-1.0.2
$ phpize
$ ./configure --with-pdo-mysql=/usr/local/mysql
$ make && sudo make install
E isso deve levá-lo ao ponto em que você pode configurá-lo.
