Podemos usar o MYSQL não na opção.
SELECT id
FROM table_one
WHERE id NOT IN ( SELECT id FROM table_two )
Editado
Se você estiver obtendo a fonte de um arquivo csv então você pode simplesmente colocar esses valores diretamente como:
Estou assumindo que o CSV é como 1,2,3,...,n
SELECT id
FROM table_one
WHERE id NOT IN ( 1,2,3,...,n );
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Ou se você quiser selecionar o contrário, então você pode usar
mysqlimport para importar dados em tabela temporária no banco de dados MySQL e recuperar o resultado e excluir a tabela. Como:
Criar tabela
CREATE TABLE my_temp_table(
ids INT,
);
carregar arquivo .csv
LOAD DATA LOCAL INFILE 'yourIDs.csv' INTO TABLE my_temp_table
FIELDS TERMINATED BY ','
LINES TERMINATED BY '\n'
(ids);
Selecionando registros
SELECT ids FROM my_temp_table
WHERE ids NOT IN ( SELECT id FROM table_one )
mesa solta
DROP TABLE IF EXISTS my_temp_table
