O que funciona e o que não funciona
Uma maneira de fazer com que ambas as transações sejam executadas sem um impasse é alterar o nível de isolamento para LER COMMITED (ou LEIA SEM COMPROMISSO ) em ambas as conexões:
SET SESSION TRANSACTION ISOLATION LEVEL READ COMMITTED;
(antes de
start transaction ). Provavelmente seria suficiente configurá-lo em
t2 , mas apenas para ter certeza do exemplo, defina-o em ambos. Alterar o nível de isolamento das transações apresenta alguns efeitos colaterais, que devem ser informados sobre no manual antes de alterar isso em um ambiente de produção.
Informações de status sobre impasse
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LATEST DETECTED DEADLOCK
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140424 8:45:46
*** (1) TRANSACTION:
TRANSACTION B6F18A3, ACTIVE 5 sec starting index read
mysql tables in use 1, locked 1
LOCK WAIT 2 lock struct(s), heap size 376, 1 row lock(s)
MySQL thread id 13885, OS thread handle 0x7f8b1dbd2700, query id 901012
localhost root statistics
SELECT * FROM t WHERE id = 1 FOR UPDATE
*** (1) WAITING FOR THIS LOCK TO BE GRANTED:
RECORD LOCKS space id 0 page no 22921 n bits 72 index `PRIMARY` of table
`test`.`t` trx id B6F18A3 lock_mode X locks rec but not gap waiting
Record lock, heap no 4 PHYSICAL RECORD: n_fields 4; compact format; info bits 0
0: len 4; hex 80000001; asc ;;
1: len 6; hex 00000b6f1883; asc o ;;
2: len 7; hex 06000059a211ea; asc Y ;;
3: len 5; hex 48656c6c6f; asc Hello;;
*** (2) TRANSACTION:
TRANSACTION B6F18A2, ACTIVE 10 sec starting index read
mysql tables in use 1, locked 1
3 lock struct(s), heap size 376, 2 row lock(s)
MySQL thread id 13888, OS thread handle 0x7f8b1f64d700, query id 901068
localhost root Updating
UPDATE t SET `descc` = 'Hello from t1'
*** (2) HOLDS THE LOCK(S):
RECORD LOCKS space id 0 page no 22921 n bits 72 index `PRIMARY` of table
`test`.`t` trx id B6F18A2 lock_mode X locks rec but not gap
Record lock, heap no 4 PHYSICAL RECORD: n_fields 4; compact format; info bits 0
0: len 4; hex 80000001; asc ;;
1: len 6; hex 00000b6f1883; asc o ;;
2: len 7; hex 06000059a211ea; asc Y ;;
3: len 5; hex 48656c6c6f; asc Hello;;
*** (2) WAITING FOR THIS LOCK TO BE GRANTED:
RECORD LOCKS space id 0 page no 22921 n bits 72 index `PRIMARY` of table
`test`.`t` trx id B6F18A2 lock_mode X waiting
Record lock, heap no 4 PHYSICAL RECORD: n_fields 4; compact format; info bits 0
0: len 4; hex 80000001; asc ;;
1: len 6; hex 00000b6f1883; asc o ;;
2: len 7; hex 06000059a211ea; asc Y ;;
3: len 5; hex 48656c6c6f; asc Hello;;
*** WE ROLL BACK TRANSACTION (1)
Explicação
Como a_horse_with_no_name mencionou, isso parece um bug no MySQL. A transação (2) deseja obter um bloqueio de lacuna na mesma linha em que já possui um bloqueio X. A transação (1) aguarda um bloqueio X sem intervalo nesta linha. Não está claro para mim por que esses pedidos devem entrar em conflito. Configurando o nível de isolamento para
READ COMMITTED desativa o bloqueio de espaço. Como o exemplo funciona, isso é uma dica de que o bloqueio de lacunas é realmente o problema aqui. 
