Você precisaria escrever uma extensão para o Liquibase que pudesse consultar o Postgres para obter a lista de funções, bem como o código para gerar o SQL correto para o Postgres descartar funções. Este não será um exercício trivial.

O básico para escrever uma extensão Liquibase está descrito no site Liquibase , mas seria necessário muito aprendizado para entender os componentes internos da Liquibase.