Acabei usando o comando copy_expert. Observe que no Windows, você precisa definir a permissão do arquivo. Esta postagem é muito útil definindo permissão .
with open(the_file, 'r') as f:
sql_copy_statement = "copy {table} FROM '"'{from_file}'"' DELIMITER '"'{deli}'"' {file_type} HEADER;".format(table = the_table,
from_file = the_file,
deli = the_delimiter,
file_type = the_file_type
)
print sql_copy_statement
cur.copy_expert(sql_copy_statement, f)
conn.commit()