Verifique se o
client_encoding
corresponde à codificação do seu arquivo. Verifique a localidade do seu sistema. Em seguida, use um argumento de linha de comando correspondente para o psql. Citando o manual aqui: Exemplo para um shell Linux:
env PGCLIENTENCODING='WIN1258' psql DB_NAME -a -f QUERY_NAME.sql
Lista de codificações disponíveis no manual.