Acho que @Zack respondeu corretamente à pergunta, mas apenas para cobrir todas as bases:
Update myTable set MyColumn = NULL
Isso definiria a coluna inteira como nula como o título da pergunta pede.
Para definir uma linha específica em uma coluna específica como nula, use:
Update myTable set MyColumn = NULL where Field = Condition.
Isso definiria uma célula específica como nula, conforme a pergunta interna.